Osrednje območje regijskega parka Škocjanske jame (4,15 km2) leži v občini Divača. V njem so naselja Škocjan, Betanja in Matavun.

V vplivnem območju regijskega parka Škocjanske jame so naselja:
Barka, Brežec, Dane, Dolnje Ležeče, Dolnje Vreme, Famlje, Goriče, Gornje Ležeče, Gornje Vreme, Gradišče, Kačiče-Pared, Kozjane, Misliče, Naklo, Ostrovica, Podgrad, Škoflje, Vareje, Vatovlje, Vremski Britof, Zavrhek

V vplivnem območju regijskega parka Škocjanske jame so naselja:
Brce, Čelje, Dobro Polje, Dolnja Bitnja, Dolnji Zemon, Gornja Bitnja, Gornji Zemon, Harije, Ilirska Bistrica, Jablanica, Janeževo Brdo, Jasen, Jelšane, Kilovče, Koseze, Kuteževo, Mala Bukovica, Mereče, Ostrožno Brdo, Pavlica, Podbeže, Podgraje, Podstenje, Podstenjšek, Pregarje, Prelože, Prem, Ratečevo Brdo, Rečica, Rjavče, Sabonje, Smrje, Soze, Studena Gora, Šembije, Tominje, Topolc, Trpčane, Velika Bukovica, Veliko Brdo, Vrbica, Vrbovo, Zabiče, Zajelšje, Zarečica, Zarečje.

V vplivnem območju regijskega parka Škocjanske jame so naselja:
Buje, Čepno, Dolnja Košana, Gornja Košana, Kal, Mala Pristava, Nadanje selo, Narin, Neverke, Nova Sušica, Ribnica, Stara Sušica, Suhorje, Tabor, Velika Pristava, Volče, Zagorje.

V vplivnem območju regijskega parka Škocjanske jame so naselja:
Artviže, Tatre.

V vplivnem območju regijskega parka Škocjanske jame so naselja:
Rakulik, Sajevče.